紫外線殺菌燈發出的253.7nm（254nm）光線，與微生物細胞中核酸的吸收光譜相吻合，從而破壞微生物機體細胞中的DNA（脫氧核糖核酸）或RNA（核糖核酸）的分子結構，造成生長性細胞死亡和（或）再生性細胞死亡，達到殺菌消毒的效果。
紫外線殺菌的效果受到紫外線照射劑量的影響，而不是簡單地由殺菌率來衡量。殺菌劑量是指細菌或微生物所接受的紫外線輻射總量，通過紫外線輻射強度和照射時間的乘積來計算。在使用紫外線殺菌時，需要保證殺菌燈的輻射強度和輻射時間，以保證殺菌劑量。雖然殺菌劑量可以用來衡量殺滅微生物的效果，但是不能直接反映出殺菌率。
不同種類的微生物對于紫外線的敏感性是不同的，所需的紫外線輻射劑量也是因微生物類型而異的。例如大腸桿菌99.99%的殺菌率必須要紫外線劑量≥20000μW.s/cm2（摘錄于GB15981標準），而枝菌99.9 9%的殺菌率則需要紫外線劑量≥100000μW.s/cm2（摘錄于GB15981標準）。然而，在現實生產中，殺菌率受到多種原因的影響，例如被照射物體的形狀、照射高度、照射時間和光照強度等。這樣，我們需要通過科學的選型方法和光學模擬協力來獲得精準數據。
雖然紫外線輻射的劑量越大，殺菌率也會相應增加，但是輻射劑量和殺菌率之間并沒有直接的線性關系。當客戶要求更高的殺菌率時，我們將根據設置的殺菌劑量、殺菌效果及成本等原因，為客戶提供相關的建設議。 如果安裝的殺菌劑數量已經達到所需要的劑量標準，但客戶仍然希望提高殺菌率，我們可以考慮增加輻照時間或提供高輻照強度等方式來提供高殺菌率。然而，需要明確產品質量和殺菌率的關系，過度提光照度或光照時間可能會導致產品質量變質或損壞。因此，在保殺菌效果的前提下，無需過分追求殺菌率。
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